目前雖然沒有可以治癒非進行性先天性肌肉病變的方法，但孩子由確診時便需要接受跨專業團隊的跟進和治療，以提升孩子的身體健康和活動的參與。

孩子需要定期到專科門診覆診以便醫生監察他/她的情況。通常在每次覆診時都需要量度生長指標和維生指數，亦有可能需要安排其他檢查，例如呼吸功能測試、肌力和體能測試等。患者亦會按需要被轉介到物理治療師、職業治療師、營養治療師和臨床心理學家等專職醫療人員再作跟進。

在某些緊急的情況下，如有呼吸困難、精神或食慾不振、體重不足甚至下降，家人應盡早求診，甚致在危急的情況下到急症室求診。

肌腱護理：常見的肌腱問題包括肌肉無力、關節攣縮、關節移位或脫位、脊柱側彎等。物理治療師會在診斷時便開始積極提供治療，並會教你如何在家裡做運動及為孩子拉筋和按摩。職業治療師會為孩子提供步行工具和各樣的支架。有時孩子亦需要進行骨科手術以改善關節脫位和脊柱側彎攣等問題。

呼吸護理：非進行性先天性肌肉病變患者會因呼吸肌肉無力引致呼吸困難，而嚴重脊柱側彎亦可影響肺部功能。醫生會定期為患者進行肺功能測試，亦會按需要建議治療，例如由治療師教導咳嗽和清痰技巧，及有需要時安排使用呼吸輔助器。一般患者會先於部分時間（例如晚上）使用非入侵性呼吸機，病情若轉嚴重便要考慮增加呼吸機的支持及配戴時間，甚至有時需要轉為用入侵性呼吸機以加强呼吸支援。另外，非進行性先天性肌肉病變患者有呼吸道感染時較容易有併發症，因此建議所有患者每年定期接種流感疫苗。

營養護理：非進行性先天性肌肉病變患者會因口部肌無力以引致吞嚥和進食困難，增加營養不足和吸入性肺炎（即食物進入氣管引致的肺炎）的風險。醫生會轉介言語治療師作進食和吞嚥評估。營養治療師亦會作出建議如何透過進食達到所需的營養。如有需要，孩子需要透過胃喉（短期方法）或胃部人工造口進食。

學習安排：除了體能障礙，有些先天性進行性肌肉萎縮症患者也有學習困難，醫生會作詳細的評估並轉介孩子致合適的學校和接受治療。

心理護理：長期病患可能影響患者的心理發展，而照顧有長期病患者的家人也有一定的壓力。如有需要，醫生可轉介孩子或患者及其家人致臨床心理學家進行評估和治療。

舒緩治療：舒緩治療的目的是要提高孩子或患者的生活質素和減少痛楚。處理痛症和疲倦是舒緩治療的一大元素。醫護團隊亦會提供心理輔導和幫助孩子和家人或患者在病情變差時的處理和安排。

其他：非進行性先天性肌肉病變可能涉及的其他健康問題包括便秘、胃酸倒流、口腔衛生等問题。醫生會針對個別問題做轉介和治療。