物理治疗师可以为患有神经肌肉疾病的儿童或成人提供康复治疗手段。物理治疗师会按个别病人的需要进行肌肉功能的训练，目标是改善功能和日常生活的自理。
治疗内容包括：
- 拉伸运动以增加或者维持上肢、下肢与身体的活动度。
- 提供夹板、矫形器、坐位设备、站位元设备等，以增加或者维持上肢、下肢与身体的活动度，改善日常功能，如坐姿和站立。假如身体情况允许，鼓励直立的姿势以改善呼吸功能。
- 提供亚极量有氧运动或者活动，以及水中运动 (如在温水中运动)，以增加或者维持上肢、下肢与躯干的肌肉力量和柔韧性。
- 通过利用无创或微创的辅助通气设备，来帮助患有神经肌肉疾病的儿童和成人维持他们的呼吸功能，清除呼吸道分泌物和预防呼吸道感染。教导家人成员或照料人员如何正确地在家使用呼吸设备。
- 提供辅助设备以最大化他们的活动功能，包括拐杖、助行架、滑轮车、手动或者自动的轮椅。
- 家访或者学校访问来协助支援家长在家里和老师在学校内如何在日常生活里照顾这些患有神经肌肉疾病的儿童和青年，并提供意见学生在校内参与适当的活动。
